Por el aire Mykonos tiene un aeropuerto, sobre 4km lejos de la ciudad principal. Hay vuelos directos a Mykonos de Atenas el Aeropuerto, Thessaloniki el Aeropuerto y de otros aeropuertos en todas partes de Europa por Vías aéreos Olímpicas y Líneas aéreas egeas. La mayor parte de los vuelos internacionales que llegan a Atenas efectúan la conexión con Mykonos. El tiempo volante de Atenas a la isla Mykonos es aproximadamente 45 minutos. En el tiempo de verano, hay varios vuelos chárter directos a Grecia Mykonos de los países diferentes de Europa, sin la transferencia en Atenas. Las escalas de precios dependiendo(según) la estación y la compañía aérea, tan su pueden encontrar tanto vuelos costosos como baratos a Mykonos.

Por Transbordadores De transporte y servicios de catamarán De alta velocidad funcionan diario de Pireo y Paros. Siendo uno de los destinos más comunes en Grecia, transbordadores regulares vienen y se marchan de Mykonos todo el año por mucho tiempo y sobre todo en el tiempo de verano, cuando Mykonos es viistado por visitantes. Los transbordadores llegan al viejo puerto situado en la capital o en el nuevo, que está en 1 o 2 kilómetros de distancia del viejo puerto. Los precios de barco a Mykonos dependen de la clase de navío (la barca o de alta velocidad) y el tiempo de año usted visita a la isla.

Por Barcos de Aerodeslizador también se marchan desde Rafina (el Ática), dos veces al día al puerto de Mykonos. El viaje está alrededor de 2 a 4 horas aproximadamente, dependiendo la línea de mar.

En autobús hay un servicio de autobús que controla el servicio regular de Mykonos a sitios diferentes como: De Mykonos a Platis Gialos - Paraíso - Psarou, de Mykonos a Aeropuerto, de Mykonos a Tourlos - Agioes Stefanos, de Mykonos a Ornos - Agioes Ioannis, de Mykonos a Ano Mera - Elia - Kalafatis - Kalo Livadi.